Podatnik, który ma siedzibę lub zarząd na terytorium Polski, podlega w naszym kraju obowiązkowi podatkowemu od całości swoich dochodów bez względu na miejsce ich osiągania. Oznacza to, że dochody uzyskane przez podatnika ze świadczenia usług na terytorium Niemiec podlegają rozliczeniu w Polsce, zgodnie z przepisami ustawy o CIT oraz postanowieniami polsko-niemieckiej umowy w sprawie unikania podwójnego opodatkowania w zakresie podatków od dochodu i od majątku (Dz. U. z 2005 r. nr 12, poz. 90), zwanej dalej umową. Jeżeli polska spółka świadczy usługi na terytorium Niemiec poprzez położony tam zakład w rozumieniu art. 5 umowy (plac budowy lub prace budowlane albo instalacyjne stanowią zakład, jeżeli trwają dłużej niż 12 miesięcy), to dochody uzyskane z tej działalności mogą być opodatkowane w Niemczech. W takim przypadku przy rozliczeniu podatku dochodowego w Polsce ma zastosowanie metoda wyłączenia z progresją (art. 24 ust. 2 lit. a umowy). Polega ona na tym, że dochód osiągnięty w Niemczech jest w Polsce zwolniony od podatku (art. 17 ust. 1 pkt 3 updop), lecz - co do zasady - może mieć wpływ na wysokość stawki podatku od pozostałych dochodów podlegających opodatkowaniu w Polsce. Natomiast jeżeli polska spółka świadczy usługi w Niemczech, nie posiadając tam zakładu w rozumieniu umowy, to dochody z tej działalności podlegają opodatkowaniu wyłącznie w Polsce.
Trzeba zauważyć, że odrębne zagadnienie stanowi obowiązujący w Niemczech podatek budowlany (Bauabzugsteuer), który wynosi 15% wartości każdej usługi budowlanej wykonanej na terytorium Niemiec na zlecenie przedsiębiorcy. Usługobiorca ma obowiązek potrącić ten podatek z kwoty wynikającej z faktury wystawionej przez wykonawcę usługi budowlanej, a następnie wpłacić go na rachunek niemieckiego urzędu skarbowego. Dotyczy to również sytuacji, gdy zgodnie z umową dochody polskiego przedsiębiorcy z tytułu świadczenia usług budowlanych na terytorium Niemiec podlegają opodatkowaniu wyłącznie w Polsce. Niemieckie przepisy podatkowe przewidują możliwość odstąpienia przez usługobiorcę od potrącenia podatku budowlanego w ściśle określonych okolicznościach, np. jeżeli wykonawca usługi przed wypłatą należności przedstawi zaświadczenie o zwolnieniu z obowiązku zapłaty tego podatku wydane przez niemiecki urząd skarbowy (Freistellungsbescheinigung) bądź jeżeli wartość świadczonych na rzecz tego usługobiorcy usług budowlanych nie przekracza 5.000 euro w danym roku. W przypadku gdy usługobiorca potrącił podatek budowlany i przekazał go do niemieckiego urzędu skarbowego, polski przedsiębiorca może podjąć starania o zwrot tego podatku. W tym celu powinien złożyć stosowny wniosek do właściwego niemieckiego urzędu skarbowego.