Wystawianie faktur w KSeF wzbudza sporo wątpliwości. Z tego względu Ministerstwo Finansów opublikowało na stronie www.podatki.gov.pl odpowiedzi na pytania dotyczące faktur ustrukturyzowanych, wyjaśniając tym samym szereg problemów, które mogą napotkać użytkownicy KSeF, w tym m.in.:
"(...) Czy faktury od dostawców zagranicznych bez polskiego NIP będą musiały być raportowane do KSeF?
KSeF nie służy do raportowania faktur od dostawców zagranicznych (...).
(...) Co w przypadku wystawienia faktury dla klienta spoza UE? Czy należy ją wystawić w wersji papierowej?
W przypadku wystawiania faktury dla podmiotu gospodarczego spoza UE, faktura będzie wystawiania za pośrednictwem KSeF i przekazywana nabywcy w sposób z nim uzgodniony. Faktura taka opatrywana będzie kodem QR (...).
(...) Czy wizualizacja faktury może być w języku obcym lub dwujęzyczna?
Wizualizacja faktury (pliku xml) może być dokonana w języku obcym (lub może być dwujęzykowa). Kluczowe jest jednak, aby treść faktury pod względem merytorycznym (po przetłumaczeniu) odpowiadała zawartości pliku xml przesłanego do KSeF (...).
(...) Jakich sytuacji dotycząc pola KursUmowny, WalutaUmowna?
Pola KursUmowny i WalutaUmowna dotyczą przypadków gdy faktura wystawiona jest w złotówkach, co oznacza, że określone w art. 106e ust. 1-10 ustawy o VAT kwoty w fakturze wyrażone są w złotych, względnie faktura jest tzw. fakturą dwuwalutową, gdzie wszystkie te kwoty są wyrażone jednocześnie w złotówkach i walucie obcej, a strony transakcji chcą w fakturze zawrzeć informację o kursie waluty w oparciu, o który dokonano takiego umownego przeliczenia (...)".
Jest to sytuacja odmienna od przypadku gdy kwoty w fakturze określone są wyłącznie w walucie obcej i jedynie kwota podatku przeliczona jest na złotówki zgodnie z art. 106e ust. 11 ustawy o VAT. Wówczas wypełniane są pola KodWaluty i KursWaluty.