Podatnik uiszcza całą kwotę podatku należnego wynikającą z deklaracji VAT - najpóźniej do końca miesiąca następującego po każdym kolejnym kwartale - na rachunek bankowy Drugiego Urzędu Skarbowego Warszawa-Śródmieście o numerze: 84 1010 1010 0165 9315 1697 8000 (dla płatności dokonywanych z zagranicy: PL84 1010 1010 0165 9315 1697 8000 kod BIC: NBPLPLPW). Wpłaty VAT powinny być dokonywane w euro.
Podatku nie należy uiszczać jako wpłaty lub przelewu podatkowego z wykorzystaniem druku określonego w rozporządzeniu Ministra Finansów z dnia 23 grudnia 2008 r. w sprawie wzoru formularza wpłaty gotówkowej oraz polecenia przelewu na rachunek organu podatkowego (Dz. U. poz. 1636) lub formatki przelewu podatkowego przygotowanego przez dany bank z którego usług korzysta podatnik. Zapłaty należy dokonać dowolną formatką przelewu bankowego lub wpłaty gotówkowej, w euro. W takiej formatce nie ma pola "symbol płatności", a podatnicy muszą jedynie wypełnić pole "tytuł", w którym wpisują numer UNR.
Poniżej przedstawiamy przykładowo wypełniony druk polecenia przelew/wpłaty gotówkowej na rachunek Drugiego Urzędu Skarbowego Warszawa-Śródmieście, tytułem wpłaty należnego podatku VAT w punkcie OSS w procedurze nieunijnej za czwarty kwartał 2023 r.
Termin złożenia deklaracji oraz zapłaty podatku, upływa również w przypadku, gdy dzień ten przypada na sobotę lub dzień ustawowo wolny od pracy.
W przypadku kiedy podatnik zarejestrowany jest w Polsce do więcej niż jednej procedury szczególnej (np. procedura unijna i procedura importu), to dla każdej z procedur powinna zostać dokonana odrębna płatność podatku VAT.