Deklarując nadwyżkę VAT naliczonego nad należnym lub kwotę podatku naliczonego do zwrotu bezpośredniego podatnik powinien wskazać termin zwrotu w części deklaracyjnej JPK_VAT.
Rozporządzenie w sprawie JPK_VAT z deklaracją określa szczegółowy zakres danych zawartych w deklaracjach podatkowych VAT oraz zawiera objaśnienia co do sposobu wypełniania i miejsca składania deklaracji. Z rozporządzenia tego wynika, że deklaracje zawierają dane niezbędne do obliczenia wysokości podatku lub zwrotu podatku wraz z oznaczeniem sposobu dokonania tego zwrotu (§ 2 pkt 10 ww. rozporządzenia). Dane te zgodnie z § 6 pkt 4 ww. rozporządzenia obejmując wysokość nadwyżki podatku naliczonego nad należnym:
a) do zwrotu na rachunek wskazany przez podatnika wraz z oznaczeniem sposobu dokonania tego zwrotu jako:
- zwrot w terminie, o którym mowa w art. 87 ust. 6d ustawy (tj. w terminie 15 dni) albo
- zwrot na rachunek VAT, o którym mowa w art. 87 ust. 6a ustawy (tj. w terminie 25 dni), albo
- zwrot w terminie, o którym mowa w art. 87 ust. 6 ustawy (tj. w terminie 25 dni), albo
- zwrot w terminie, o którym mowa w art. 87 ust. 2 ustawy (tj. w terminie 40 dni), albo
- zwrot w terminie, o którym mowa w art. 87 ust. 5a zdanie pierwsze ustawy (tj. zwrot w terminie 180 dni),
b) do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy.
Podobnie w objaśnieniach co do sposobu wypełniania i miejsca składania deklaracji oraz sposobu wykazywania danych w ewidencji przesyłanej zgodnie z art. 109 ust. 3b i 3c ustawy o VAT (punkt 6.1.), stanowiących załącznik do ww. rozporządzenia, wskazano, że podatnik wykazuje wysokość nadwyżki podatku naliczonego nad należnym do zwrotu na wskazany przez siebie rachunek wraz z oznaczeniem sposobu dokonania tego zwrotu poprzez wybranie konkretnego pola wyboru (tak jak powyżej w punkcie a)). Zatem z przywołanych powyżej przepisów wykonawczych do ustawy o VAT wynika sposób realizacji przez podatnika zwrotu nadwyżki podatku naliczonego nad należnym. Występując o zwrot różnicy podatku na swój rachunek, podatnik w części deklaracyjnej pliku JPK_VAT z deklaracją wskazuje, który z przewidzianych przez ustawodawcę trybów zwrotu wybiera - czy tak jak w treści pytania zwrot na rachunek VAT (o którym mowa w art. 87 ust. 6a ustawy o VAT) czy też zwrot w terminie określonym w art. 87 ust. 2 tej ustawy. Użycie przez ustawodawcę spójnika "albo" oznacza, że podatnik nie może podzielić kwoty zwrotu pomiędzy oba wskazane tryby. Tym samym niedopuszczalne jest dokonanie części zwrotu na rachunek VAT w terminie 25 dni, a pozostałej części na rachunek rozliczeniowy podatnika w terminie 40 dni.
Takie stanowisko potwierdził Dyrektor KIS w interpretacji indywidualnej z dnia 11 sierpnia 2026 r., nr 0111-KDIB3-3.4012.214.2026.1.MPU. Czytamy w niej m.in.: "(...) możliwy jest wybór wyłącznie jednego rodzaju zwrotu różnicy podatku, tzn. podatnik nie może wystąpić w jednej deklaracji o zwrot części nadwyżki na rachunek VAT i jednocześnie o zwrot pozostałej części na rachunek rozliczeniowy.
Konstrukcja przepisu art. 87 ust. 6a ustawy, wskazuje, że przepis ten nie dopuszcza możliwości »podziału« przez podatnika w jednej deklaracji kwoty nadwyżki podatku naliczonego nad należnym, o której mowa w ust. 2 i wykazania części tej nadwyżki do zwrotu w terminie 25 dni na rachunek VAT, a w pozostałej części do zwrotu na rachunek rozliczeniowy. Przepis ten wskazuje, że urząd skarbowy jest obowiązany dokonać zwrotu różnicy podatku, o której mowa w ust. 2, na rachunek VAT podatnika, zatem urząd skarbowy zwraca różnicę - a nie jej część - pomiędzy kwotą wykazanego podatku należnego, a kwota podatku naliczonego, które podatnik ujął w deklaracji. Przepisy ustawy o VAT nie pozwalają, aby w JPK_VAT w części deklaracyjnej podatnik wykazał część nadwyżki podatku naliczonego nad należnym do zwrotu na rachunek VAT, a pozostałą część do zwrotu na rachunek bankowy (...)".
| Reasumując
Spółka nie może wystąpić w jednej deklaracji o zwrot części nadwyżki na rachunek VAT (w terminie 25 dni) i jednocześnie o zwrot pozostałej części na rachunek rozliczeniowy (w terminie 40 dni). Możliwy jest wybór wyłącznie jednego rodzaju zwrotu różnicy podatku. |